Η συνεργασία της Αδελφότητας με τον Δήμο Αθηναίων και το Μουσείο Λαϊκής Τέχνης και Παράδοσης «Αγγελική Χατζημιχάλη» ξεκίνησε το 1980–1981, σχεδόν αμέσως μετά την ίδρυση του Μουσείου, και συνεχίζεται αδιάλειπτα έως σήμερα, με εξαίρεση τα διαστήματα κατά τα οποία το κτίριο παρέμενε κλειστό λόγω εργασιών. Δεν θα ήταν υπερβολή να ειπωθεί ότι η παρουσία των Σαρακατσαναίων στον χώρο του Μουσείου είναι συνυφασμένη με την πορεία της Αδελφότητάς μας.

Η συνεργασία εγκαινιάστηκε με την παρουσίαση αυθεντικών αντικειμένων της σαρακατσάνικης ζωής και την κατασκευή ενός σαρακατσάνικου κονακιού από μέλη της Αδελφότητας. Το αρχικό κονάκι παρέμεινε στον χώρο για αρκετά χρόνια, έως ότου απομακρύνθηκε λόγω φυσικής φθοράς των υλικών. Τα υπόλοιπα αντικείμενα της Αδελφότητας,ωστόσο, συνέχισαν να εκτίθεται κανονικά.

Το 1995 — ή και ενδεχομένως νωρίτερα — προστέθηκε στη μόνιμη έκθεση ένας αυθεντικός «αργαλειός γούρνας», όμοιος με εκείνους που έστηναν οι Σαρακατσαναίοι κατά τον νομαδικό τους βίο. Πρόκειται για εξαιρετικά σπάνιο έκθεμα, καθώς μέχρι σήμερα δεν έχει εντοπιστεί αντίστοιχος αργαλειός σε άλλο μουσείο της χώρας.

Το 2015, με αφορμή τη συμπλήρωση πενήντα ετών από τον θάνατο της Αγγελικής Χατζημιχάλη, η έκθεση ανανεώθηκε και εμπλουτίστηκε με νέα αντικείμενα από τη συλλογή της Αδελφότητας, καθώς και με φωτογραφικό υλικό από το αρχείο της. Η ανανέωση πραγματοποιήθηκε με την επιμέλεια της λαογράφου και διευθύντριας του Μουσείου, κας Σταυρούλας Πισιμίση. Έκτοτε, η μεγάλη αίθουσα του επάνω ορόφου φιλοξενεί μόνιμη έκθεση αφιερωμένη αποκλειστικά στους Σαρακατσαναίους.

Το 2025 η Αδελφότητα προχώρησε στην κατασκευή νέου, ορθού σαρακατσάνικου κονακιού στο εσωτερικό του Μουσείου, με τη συμβολή μελών που έζησαν οι ίδιοι τις πρώτες δεκαετίες της ζωής τους μέσα σε σαρακατσάνικες κοινότητες. Το νέο κονάκι αποτελεί πλέον αναπόσπαστο τμήμα της μόνιμης έκθεσης. Παράλληλα, πραγματοποιήθηκαν εργασίες συντήρησης του αργαλειού γούρνας, ο οποίος σήμερα λειτουργεί εκ νέου.

Σήμερα, στη μόνιμη έκθεση φιλοξενούνται περισσότερα από 120 αντικείμενα της Αδελφότητας, τα οποία αποτυπώνουν με αυθεντικότητα πτυχές της νομαδικής ζωής, της οικογενειακής οργάνωσης και της υλικής και πνευματικής παράδοσης των Σαρακατσαναίων.

Το Μουσείο λειτουργεί όλες τις ημέρες της εβδομάδας, πλην Δευτέρας, με ελεύθερη είσοδη για το κοινό. Η θέση του, στην καρδιά της Πλάκας, το καθιστά έναν από τους σημαντικότερους και πλέον επισκέψιμους πολιτιστικούς χώρους της Αθήνας, προσελκύοντας τόσο μεμονωμένους επισκέπτες όσο και σχολεία από όλη την Ελλάδα.